NYC atık suları, şifreli COVID varyantları ile pandeminin daha kötü aşamaları arasında bir bağlantı olduğunu gösteriyor

Columbia Üniversitesi araştırmacıları yeni bir çalışmada, New York City atık suyunda ciddi hastalık oranları yükselmeye başladığında ortaya çıkan koronavirüs mutasyonlarını tespit ettiler. Bulgular, pandemideki hastaneye yatış ve ölüm de dahil olmak üzere günlük sonuçları etkileyen, doktorlar fark etmeden, göze çarpmayan, abartısız değişkenleri saptayabilir.

Columbia’da doktora sonrası araştırmacı olan ve 2020 sonbaharından 2022 kışına kadar olan verileri içeren araştırma üzerinde çalışan Archana Anand, “Atık su bir havuzlanmış örnektir” dedi. Araştırmacılar, bu atık su örneklerinden genetik bilgi toplayarak aralarında dolaşan virüs türlerini inceleyebilir. Bu bilgiyi bir seferde bir PCR test swabı toplamak yerine yüz binlerce insanı bir kerede toplayın.

Anand, bu yeni mutasyonların ne yaptığına dair potansiyel ipuçlarını belirlemek için atık su verilerini New York City ve New Jersey sağlık departmanlarından vakalar, hastaneye yatışlar ve ölümler hakkındaki verilerle ilişkilendirdi. New Jersey’nin kuzeyindeki Manhattan fabrikası ve Bergen County, New Jersey’de hizmet verilen posta kodlarındaki COVID-19 kalıplarını bu kanalizasyonlarda bulunan mutasyonlara bağlayarak, koronavirüsün daha hızlı hareket etmesine ve insanların bağışıklık sistemlerinden kaçmasına yardımcı olabilecek bazı mutasyonlar buldu.

Örneğin, N proteini üzerinde üç mutasyon tespit etti – virüsün bir parçası olan ve genetik materyalini koruyan ve diğer işlevlere hizmet eden bir parça. Bu mutasyonlar atıksuda mevcut olduğunda hastaneye yatış, mortalite ve test pozitifliği oranları daha yüksekti.

Columbia ekibi, mühendislik profesörü ve atık su uzmanı Kartik Chandran tarafından yönetiliyor. Pandemiden önce, Chandran izlenen mikrobiyal topluluklar atıksuda, laboratuvarının kolayca koronavirüse dönmesine neden oluyor.

ABD’deki çoğu atık su gözetimi ölçüme odaklanır ne kadar koronavirüs var belirli bir kanalizasyonda. Ancak Chandran daha karmaşık soruları yanıtlamakla ilgileniyor.

“Sadece ‘kim’ ve ‘kaç’ değil” dedi. “İşlev ve aktivite bu.”

Başka bir deyişle: sadece kanalizasyonda ne kadar koronavirüs olduğu değil, hangi varyantlar ve bu varyantların neler yapabileceğidir.

Missouri Üniversitesi’nde mikrobiyoloji ve immünoloji profesörü olan Marc Johnson, PCR testleri yerine atık su yoluyla varyantları izlemenin “daha kapsamlı” olduğunu söyledi. eyaletin atık su gözetim programı ve Columbia çalışmasına dahil değildi.

“Size herkesi anlatıyor,” dedi, “hasta olduklarını bile bilmeyenler” de dahil. Atık su gözetimi, kısmen bu sayede geçtiğimiz yıl daha yaygın hale geldi. Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezlerinden sağlanan fon. Ancak atık su testinin ayarlanması – ve varyant takibinin dahil edilmesi – sağlık departmanları için lojistik olarak zor.

Anand ve meslektaşları, artan bulaşma veya ciddiyetin potansiyel itici güçleri olarak daha fazla ilgiyi hak ettiğini söyledikleri belirli koronavirüs mutasyonlarını işaretlediler. Henüz hakem değerlendirmesinden geçmemiş olan çalışmaNew York City’deki bir sonraki önemli varyantı belirlemek veya hatta varyanta özel tedaviler ve aşılar tasarlamak için bir başlangıç ​​noktası olabilir.

bu COVID-19 projesini belgelemekBu makaleyi yayınlamak için Gothamist ile ortak olan , COVID-19 için atık su gözetimi üzerine devam eden araştırmasının bir parçası olarak yazarları ve dışarıdan uzmanlarla röportajlar yoluyla bu çalışmanın sonuçlarını araştırdı. Belgeleme COVID-19 projesi, bu çalışmayı yürüten laboratuvara bağlı olmayan Columbia Üniversitesi’nin Brown Medya İnovasyonu Enstitüsü tarafından kısmen desteklenmektedir.